出入境管理局設(shè)在法務(wù)省內(nèi)。在東京、大阪、名古屋、札幌等8個城市設(shè)立出入境管理局、4個支局和101個辦事處。在國外由各駐外大使館和領(lǐng)事館主管出入境簽證事務(wù)。在各科境口岸設(shè)有入境審查官，主管入境簽證、證件的查驗和居留期限、居留資格的認定工作。日本的簽證事務(wù)由外務(wù)大臣與法務(wù)大臣進行協(xié)商決定。一般長期居留簽證，就業(yè)簽證等需要事前審查，大總值發(fā)都要由外大臣與法務(wù)大臣協(xié)商。簽證的事前審查要由在外使領(lǐng)館向外務(wù)大臣向法務(wù)大臣提出。然后外務(wù)大臣向法務(wù)大臣提出。法務(wù)省入境管理局通過各種渠道了解入境的真實目的后，然后由法務(wù)大臣向外務(wù)大臣提出是否給予簽證的意見。所以此類簽證，從提出申請到發(fā)放簽證需要相當?shù)臅r間。日本駐華使館負責辦理其駐華領(lǐng)事館領(lǐng)區(qū)以外人員申請前往日本的簽證。日本駐華領(lǐng)事館負責辦理其領(lǐng)區(qū)范圍內(nèi)人員申請前往日本的簽證。簽證所需時間一般為8-10天。日本于1951年公布了第一個出入境管理法，即《出入境管理令》，第二年制訂《外國人登記法》。1982年公布了《外國人登陸法》，并且再次修定了《出入境管理令》，將其更改為《出入境管理暨難民認定法》，并在1990年實施修訂的法案。該法主要內(nèi)容分為外國人入境、居留、出境、驅(qū)逐出境、日本人的出國和歸國等。日本政府實行的入境管理制度同大多數(shù)國家一樣，對不同的入境者發(fā)給不同的入境簽證。不同的居留資格一般是由不同種類的簽證或加注來表示的。日本的簽證種類用阿拉伯字母來表示，從4-1-1一直排列到4-1-16。
例如，到日本進行旅游觀光、探親訪友的，居留資格為4-1-4；留學生的居留資格為4-1-6；到日本進行科研數(shù)學活動的，其居留資格為4-1-7等等。其中4-1-16又劃分為1、2、3三個類別，居留資格又分為普通居留資格、中級居留資格、高級居留資格和特殊居留資格四種。日本駐外大使館或領(lǐng)事館在簽發(fā)入境簽證時，一般直接在簽證下方注明居留資格編號，進入日本國境，入國檢查官員在護照相館上加蓋“上陸許可”印章的同時，也同樣注明居留資格編號，表示進一步確認入境者的身份。
日本《出入境管理令》有關(guān)條款規(guī)定的各種逗留資格及其逗留期限如下：
1． 外交官、領(lǐng)事官、隨員及家屬的逗留期限不受限制。
2． 從事日本政府所承認的外國政府及國際機構(gòu)的公務(wù)人員及其家屬逗留期限也不受限制。
3． 過境者的逗留期限為15天。
4． 觀光者，還包括由娛樂、休養(yǎng)、民間團體主辦的會議的參加者，競技、比賽等的參加者、親朋間的探親訪問，插花、茶道、柔道、禪等日本固有技藝的進修、宗教巡禮、友好城市及學校等組織的訪問以及不從事伴有收益活動的其他入境者）的逗留期限為60天。
5． 從事貿(mào)易、事業(yè)及投資活動的人員（企業(yè)的管理與經(jīng)營者）的逗留期限為3年。
6． 留學生（在短期大學以上的教育機構(gòu)從事研究和接受教育的人員）的逗留期限為1年。
7． 在學術(shù)研究機構(gòu)及教育機構(gòu)從事研究指導和接受的人員（包括在短期大學以上的教育、研究機構(gòu)任講師、副教授、教授之職的人員）的逗留期限為3年。
8． 從事藝術(shù)及學術(shù)上的活動人員（包括音樂、美術(shù)、文學、科學及其他藝術(shù)上和科學上的活動人員）的逗留期限為1年。
9． 伴有收入的演劇、演藝、演奏、體育表演等行為的人員，逗留期限為60天。
10． 為從事宗教活動，由外國宗教團體派遣的人員，逗留期限為3年。
11． 作為外國親聞、廣播、電影及其他傳播媒介的派遣員來日的工作人員，逗留期限為3年。
12． 國內(nèi)公共、私人機構(gòu)招聘的，提供產(chǎn)業(yè)上的高技術(shù)或特殊技術(shù)的人員，逗留期孕婦為3年。
13． 從事熟練勞動的人員（如中華料理的廚師、點心制造人員等，但一般不允許單純的勞工入境），逗留期限為1年。
14． 永久居住的人員，逗留期限為永久性。
15． 逗留資格為5-13項的人員的配偶及其未成年子女（即所謂被扶養(yǎng)者）。逗留期限與其撫養(yǎng)者的逗留期限相同。
16． 逗留資格為5、10、11、12各項的人員中短期逗留者及其家屬，逗留期限為180天。
17． 1952年法律第126條第2號第6項規(guī)定的人員的子女并在該法律實施之日后在日本出生的人員，逗留期限為3年。
18． 法務(wù)大臣特許的逗留人員（不屬于其他逗留資格的人員，例如醫(yī)生、技術(shù)研究修生、語言學術(shù)教師、各種學校學生、日本人無養(yǎng)親族等。別外，即使從事其他逗留資格的活動，但逗留期限與逗留資格規(guī)定的逗留期限不同的場合，也適于此），其逗留期限在3年范圍內(nèi)個別指定。
19． 1953年政令第404號第14條第2項規(guī)定的人員的子女并在該法實施之日后在日本出生的人員，逗留的期限為3年。在上述逗留資格中，如果是6（留學生）、7（邀請教授）、12（技術(shù)人員）和13（熟練勞動者）資格的人員，以申請入境時，必須持有相當其逗留資格的法務(wù)大臣的資格證明書。該資格證明書，除在本人申請簽證時一并向日本在外使領(lǐng)館提出外，還可以在持有4（觀光客）等資格簽證在日本逗留期間，向據(jù)入境管理事務(wù)所提出申請；或者由在日本居住的保證人向入境管理事務(wù)所代理申請，然后再寄送給國外的本人。
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